Tipos de base de datos biológica en bioinformática

Bases de datos biológicas :

  • Estas son las bases de datos que consisten en datos biológicos como secuenciación de proteínas, estructura molecular, secuencias de ADN , etc. en forma organizada.
  • Existen varias herramientas informáticas para manipular los datos biológicos, como actualizar, eliminar, insertar, etc. Los científicos e investigadores de todo el mundo ingresan los datos y resultados de sus experimentos en una base de datos biológica para que esté disponible para una audiencia más amplia.
  • Las bases de datos biológicas son de uso gratuito y contienen una gran colección de una variedad de datos biológicos.

Usos de las bases de datos biológicas:

  • Ayuda a los investigadores a estudiar los datos disponibles y formar una nueva tesis, antivirus , bacterias útiles, medicamentos, etc.
  • Ayuda a los científicos a comprender los conceptos de los fenómenos biológicos.
  • La base de datos actúa como un almacén de información.
  • Ayuda a eliminar la redundancia de datos.

Tipos de bases de datos biológicas:

Hay básicamente 3 tipos de bases de datos biológicas que son las siguientes.

1. Bases de datos primarias:

  • También puede denominarse base de datos de archivo, ya que archiva los resultados experimentales presentados por los científicos. La base de datos principal se llena con datos derivados experimentalmente, como la secuencia del genoma, la estructura macromolecular, etc. Los datos ingresados ​​​​aquí permanecen sin curar (no se realizan modificaciones sobre los datos).
  • Obtiene datos únicos obtenidos del laboratorio y estos datos se hacen accesibles a los usuarios normales sin ningún cambio.
  • Los datos reciben números de acceso cuando se ingresan en la base de datos. Los mismos datos se pueden recuperar más tarde utilizando el número de acceso. El número de acceso identifica cada dato de manera única y nunca cambia.

Ejemplos –

  • Ejemplos de bases de datos primarias: bases de datos de ácidos nucleicos son GenBank y DDBJ  
  • Las bases de datos de proteínas son PDB, SwissProt, PIR, TrEMBL, Metacyc, etc.

2. Base de datos secundaria:

  • Los datos almacenados en este tipo de bases de datos son el resultado analizado de la base de datos primaria. Los algoritmos computacionales se aplican a la base de datos primaria y los datos significativos e informativos se almacenan dentro de la base de datos secundaria. 
  • Los datos aquí están altamente seleccionados (procesando los datos antes de que se presenten en la base de datos). Una base de datos secundaria es mejor y contiene conocimientos más valiosos en comparación con la base de datos principal.

Ejemplos –

Ejemplos de bases de datos secundarias son los siguientes.

  • InterPro (familias de proteínas, motivos y dominios)
  • UniProt Knowledgebase (secuencia e información funcional sobre proteínas)  

3. Bases de datos compuestas:

  • Los datos ingresados ​​en este tipo de bases de datos primero se comparan y luego se filtran según los criterios deseados. 
  • Los datos iniciales se toman de la base de datos principal y luego se fusionan en función de ciertas condiciones. 
  • Ayuda a buscar secuencias rápidamente. Las bases de datos compuestas contienen datos no redundantes. 

Ejemplos –

Ejemplos de bases de datos compuestas son los siguientes.

  • Bases de datos compuestas -OWL,NRD y Swissport +TREMBL

Publicación traducida automáticamente

Artículo escrito por pradiptamukherjee y traducido por Barcelona Geeks. The original can be accessed here. Licence: CCBY-SA

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